Une version tardive du sujet traité deux fois déjà dans
ses années italiennes (voir la version
Minneapolis de 1578). La scène est limitée au groupe principal,
suivant en cela de la conception originale d'il y a environ quarante ans,
qui suivait elle-même une conception de Michel-Ange.
Une plus grande force expressive est atteinte par cette concentration sur un groupe, infiniment augmentée qui plus est par la vitalité de la couleur. L'effet négatif de l'espace vide du côté droit de ses anciennes versions a été éliminé. L'effet de perspective du carrelage, l'aspect tridimentionnel des figures et la virtuosité dans la descritionde la voute ont également été supprimé: seul l'événement est exprimé, et crée son propre espace.
L'homme à la barbe grise au premier plan est l'apôtre Pierre, reconnaissable à ses robes bleues et jaunes traditionnelles. Le motif vénitien de la figure feminine étendue des versions précédentes est remplacé par la figure masculine se pliant vers le bas, qui peut être un souvenir du dessin d'une ébauche de tapisserie de Raphael racontant la pêche miraculeuse.
Les motifs à gauche et à droite de la voûte représentent Adam et Eve chassés du jardin d'Eden et le sacrifice d'Isaac. Adam et Eve sont un parallèle pour les commerçants pécheurs : ils ont été chassés du paradis, le jardin de Dieu, tout comme Christ chasse ceux qui se livrent au commerce du temple, la maison de Dieu. Le sacrifice d'Isaac symbolise non seulement l'obéissance à la volonté de Dieu, mais aussi le propre sacrifice du Christ lors de sa crucifixion, qui a été vu pour racheter le péché d'Adam et Eve.
Dans cette version tardive, le Greco s'est conformé aux texte de Jean, "furieux que la maison de son père – la maison de Dieu – soit utilisée à des fins lucratives, il fit un fouet avec de petites cordes e] les chassa tous du temple » (Jean II : 14-16) et de saint Matthieu en représentant les "tables et les sièges renversées des prêteur et de ceux qui ont vendu les colombes" (XXI, 12).